总体原则
图件必须清楚、克制、可复现、可编辑。
默认绘图语言和库
若用户没有指定语言，优先使用 R 绘图。 绘图默认使用 ggplot2。 R 主题统一使用 theme_classic()。 Python 仅保留 Matplotlib 和 Seaborn。 不要主动引入复杂依赖。 若使用 Python，默认使用 aquarel 的 boxy_light 主题。 若环境缺少 aquarel，应提示安装：pip install aquarel。
文字语言规则
默认情况下，图中所有文字必须使用英文。 包括标题、坐标轴、图例、分组标签、注释、分面标签和统计标注。 除非用户明确要求中文，否则图中不准出现中文。 代码注释和解释可以使用中文，但图中文字不应使用中文。 英文标签使用简洁表达。 单位写在英文括号中，例如 Distance (km)。 避免全大写标签，除非是基因名、缩写或期刊要求。
字体规则
所有图中文字默认使用 Arial。 所有图中文字默认字号为 6 pt。 坐标轴标题、刻度文字、图例文字、注释文字和分面标签默认都使用 6 pt。 除非用户或期刊明确要求，不要自行放大或缩小不同元素。 字体必须在导出的矢量文件中保持可编辑。 不要把文字转成路径、轮廓或不可编辑对象。 不要使用会导致文字转曲的导出方式。 若 Arial 不可用，应明确说明，并使用最接近的无衬线字体临时代替。 正式交付前应尽量恢复 Arial。
Python 默认设置
使用 Python 绘图时，采用以下最小配置。
import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
from aquarel import load_theme
# Install with: pip install aquarel
# sns.set_style("white")
theme = load_theme("boxy_light")
theme.apply()
plt.rcParams["font.sans-serif"] = ["Arial"]
plt.rcParams["font.size"] = 6
plt.rcParams["axes.labelsize"] = 6
plt.rcParams["xtick.labelsize"] = 6
plt.rcParams["ytick.labelsize"] = 6
plt.rcParams["legend.fontsize"] = 6
plt.rcParams["pdf.fonttype"] = 42
plt.rcParams["ps.fonttype"] = 42
plt.rcParams["svg.fonttype"] = "none"
pdf.fonttype = 42 和 ps.fonttype = 42 用于保留可编辑 TrueType 字体。 svg.fonttype = "none" 用于让 SVG 中的文字保持为文本。 保存 PDF 或 SVG 后，应检查文字是否可以在 Illustrator、Inkscape 或类似软件中编辑。 完整模板位于 templates/python_minimal_template.py。
R 默认设置
使用 R 绘图时，默认使用 ggplot2。 默认主题为 theme_classic(base_family = "Arial", base_size = 6)。 所有文字元素继承 6 pt 和 Arial。 若额外设置 theme，必须保持 Arial、6 pt 和可编辑字体。 默认使用 ggsave() 导出图件。 若需要保证 PDF 字体可编辑，优先使用 device = cairo_pdf。 不要默认使用 showtext 将字体转为轮廓。 不要默认使用会让文字不可编辑的位图导出方式作为唯一结果。 完整模板位于 templates/r_minimal_template.R。
配色规则
本 skill 不强制规定配色方案。 若用户指定配色，应遵守用户指定。 若其他 skill 已指定配色，应遵守其他 skill 的配色规则。
图形选择
根据数据类型选择图形。 连续变量之间的关系优先考虑散点图、回归图或二维密度图。 时间序列优先考虑线图。 分组连续值优先考虑箱线图、小提琴图、点图或均值误差图。 组成比例可以使用堆叠柱图，但避免过多类别。 相关矩阵、距离矩阵和表达矩阵可以使用热图。 样本量较小时，优先显示原始点。 样本量较大时，可使用透明度、密度或汇总统计。 不要只显示柱状图而隐藏原始数据，除非用户明确要求。
坐标轴和标签
坐标轴必须有明确英文标签。 有单位的变量必须标注单位。 不要使用过密刻度。 不要让刻度标签相互重叠。 标签只能为 90° 或 0°，除非用户明确要求。
图例、注释和统计标注
图例应简洁，且不能遮挡数据。 若直接标注曲线或分组更清楚，可以省略图例。 注释只用于解释必要信息，不要在图中堆叠长段文字。 统计显著性标注必须基于实际统计结果。
多面板图
多面板图必须保持统一字体、字号、线宽、点大小和标签风格。 面板标签使用英文大写字母：A, B, C。 面板标签默认使用 Arial、6 pt、加粗。
导出规则
默认导出为 PDF + 配套 PNG。 PNG 不能作为唯一正式交付格式，除非用户明确要求。 Python 默认使用 bbox_inches = "tight"。 R 默认使用 ggsave()。 导出后应检查字体、裁切、图例、分辨率和文字可编辑性。
交付前检查
图中文字是否全部为英文。 字体是否为 Arial。 字号是否为 6 pt。 PDF 或 SVG 中字体是否可编辑。 坐标轴和单位是否清楚。 图例是否必要且不遮挡数据。 多面板风格是否一致。 是否避免了 JPEG。 是否输出了可继续编辑的矢量文件。 是否没有强行套用配色。 是否没有添加未经计算的统计标注。
文件结构
本精简版 skill 只保留少量文件。 SKILL.md 是主要规则文件。 templates/python_minimal_template.py 是 Python 最小模板。 templates/r_minimal_template.R 是 R 最小模板。 references/essential_references.md 只保留必要参考说明。 优先维护 SKILL.md，不要扩展出大量参考文件。